Ómicron, lo que no sabemos de la nueva variante

No sabemos si es más transmisible, no sabemos sí sustituirá a otras variantes, no sabemos si es más virulenta y causará enfermedad más grave, no sabemos si será más fácil de reinfectarse, no sabemos si será más peligrosa en niños pequeños, no sabemos si escapará de las vacunas actuales, no sabemos si se extenderá por todo el planeta…, pero tenemos que vigilarla.

Detectada por PCR los días 11-23 de noviembre en Sudáfrica, en la provincia de Gauteng (77 casos), Botswana (4 casos) y en Hong-Kong (un caso), Israel (un caso) y Bélgica (uno caso). Parece ser que se ha extendido muy rápidamente en la región de Gauteng, pero hay que tener en cuenta que es una zona con muy pocos casos de COVID-19 y con una tasa de vacunación muy baja. Eso ha podido influir. ¿Es realmente más transmisible o es un efecto de la población en la que se ha aislado? Cómo se comportará esta variante en otra población donde la incidencia y la tasa de vacunación sean mayores… no se sabe. Pero tenemos que estar vigilantes.

Otra denominación: B.1.1.529. No asociada a síntomas nuevos. Detectada en infectados asintomáticos.

Tiene más de 50 mutaciones en su genoma, respecto a la secuencia original de Wuhan. Treinta y dos de ellas en la región de la proteína S.

Lo que preocupa a los científicos es la acumulación de mutaciones en esa región, algunas de esas mutaciones ya se habían detectado en otras variantes, pero no todas juntas en una misma variante. Por eso, esta variante ya ha sido clasificada como variante de preocupación. Más que el número de mutaciones, lo que conviene analizar es el efecto que puedan tener todas juntas. Una cosa es la mutación en el genoma y otra, muy distinta el efecto que pueda tener en la biología del virus. El efecto no tiene porque ser acumulativo, pueden darse fenómenos de compensación: el efecto de una mutación se compensa con el de otra.

Pero esta variante acumula mutaciones que se han relacionado con un posible escape inmunológico y un posible aumento de la transmisibilidad.

(Fuente: @jcbarret)

Nueve mutaciones (en rojo) aparecen en otras variantes alfa, beta, delta, gamma. Once (en azul) son nuevas. Quince mutaciones están en la zona de unión al receptor (RBD) y algunas (N440K, S477N, Q498R) afectan a la unión al receptor ACE2 y podrían influir en su capacidad de infectar células, otras pueden afectar a la transmisibilidad (H655Y, N679K, P681H), y las hay que pueden causar cambios en la proteína y afectar a su reactividad con los anticuerpos:

(Fuente: @jbloom_lab)

Por otra parte, un análisis filogenético con los genomas de esta variante sugiere que probablemente esta variante esté circulando desde hace meses pero que no se haya detectado hasta ahora:

(Fuente: @trvrb)

¿Hay motivo para una alarma e histeria generalizada? En este momento (27/11/2021) no. Es más lo que no sabemos que lo que sabemos. Pero hay que seguir vigilantes.

¿Qué podemos hacer? Tranquilidad, no alarmar a la población, seguir estudiando y vacunarse.

¿Cancelamos todos los vuelos con Sudáfrica? Yo creo que no tiene mucho sentido, por varias razones. Sudáfrica es probablemente el único país africano que está haciendo “la tarea” y hace un seguimiento genómico del virus. Por eso lo detecta. Si no buscas de forma activa nuevas variantes, no las detectas, pero no quiere decir que no surjan. Castigar al que lo está haciendo bien es un error. No podemos descartar, seguro que es lo más probable, que surgen nuevas variantes en otras zonas donde no se están buscando, en otros países de alrededor. ¿Cancelamos entonces todos los vuelos con África? Esta variante ya se ha detectado en Hong-Kong y Bélgica, muy probablemente esté desde hace tiempo, como se ha sugerido, en otros lugares del planeta.

Necesitamos tiempo para conocer más sobre esta variante. Pero lo que esto demuestra una vez más es que estamos en una pandemia global y lo que ocurra en otros países nos afecta. Cuantos más infectados haya por el mundo, más virus habrá, más variantes podrán surgir. La vacunación debe ser global. Y en África poco más del 7% de la población está vacunado. Eso es lo que nos debería alarmar.

Más información: Threat Assessment Brief: Implications of the emergence and spread of the SARS-CoV-2 B.1.1. 529 variant of concern (Omicron) for the EU/EEA. ECDC.

Actualización (11/12/2021)

  1. Los datos de Sudáfrica, Reino Unido y Dinamarca, países que secuencian mucho, sugieren que Ómicron se expande más deprisa.
  2. Algún estudio demuestra que Ómicron es más resistente (40x) a los anticuerpos neutralizantes, lo que quizá explique que sea más transmisible.
  3. Eso no quiere decir que escape a las vacunas, la respuesta vacunal es mucho más compleja e implica inmunidad celular. De momento seguimos sin saber si esta variante será más resistente a las vacunas.
  4. Seguimos sin saber si Ómicron causa una enfermedad más grave. Hay datos que sugieren que es capaz de infectar a vacunados y de causar reinfección, gente en principio más protegida, por lo que no sabemos si causa enfermedad más severa en no vacunados.
  5. Lo que sigue siendo muy eficaz para controlar la pandemia son las vacunas, la mascarilla y la ventilación.

Para más información: ECDC.

Actualización (21/12/2021)

  1. Alta transmisibilidad.
  2. Escape a la respuesta de anticuerpos neutralizantes significativa.
  3. Inmunidad celular menos comprometida.
  4. La tercera dosis aumenta la cobertura.
  5. Se transmite entre vacunados y convalecientes.
  6. Se diagnostica bien por PCR y test de antígenos (en revisión).
  7. Tratamiento: Molnupiravir/Paxlovid no se ven afectados.
  8. Tratamiento: anticuerpos monoclonales sí se ven muy afectados (con alguna excepción).
  9. Todavía nos sabemos si es más virulento ni cómo evolucionará.

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Ómicron: proponer soluciones

6 Comments

  1. Buen articulo y pues en verdad se debe seguir monitoreando este virus y otros. Pues la tranquilidad ya no existe y al parecer tendremos que estar alertas todo el tiempo y tratando de seguir nuestras rutinas de limpieza, de desinfección y de salidas muy responsables.

  2. Hasta que no proporcionemos suficientes a Africa . Seguiremos con las mutaciones y el peligro de nuevos contagios a nivel global continuaara

  3. Hay que tener mesura y rigor en las apreciaciones científicas, como la que aportas en una variante, que no tipo nuevo, si no se causa relajación por aburrimiento en la población. Las medidas de control, las mismas, lo demás es frivolidad informativa.

  4. Qué razón hay para que en Navarra el porcentaje de casos sea muy superior al de otras regiones?
    La tasa de vacunación es alta y no veo que en Navarra haya más aglomeraciones que en otras regiones.

    • No encuentro respuesta a esa pregunta, soy incapaz de entender por qué Navarra va a la cabeza de contagios en España. Quizá sea el presagio de lo que va a pasar en el resto.

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